Скотт Уилсон родился в Оаквилле, Канада. Свою карьеру начинал в юниорских командах «Оаквилль Рейнджерс» (SCTA, 2006-2009), «Джорджтаун Райдерс» (OJHL, 2009-2011), «ЮМасс-Ловелл» (NCAA, 2011-2014). В 2011 Скотт был выбран в седьмом раунде драфта НХЛ под общим 209 номером «Питтсбург Пингвинз», и перебрался туда в 2014 году. С 2014 по 2018 защищал цвета «Питтсбурга» в НХЛ и фарм-клуба «Уикз-Берри/Скрэнтон Пингвинз» в АХЛ. Вместе с «Питтсбургом» Скотт выиграл Кубок Стэнли в сезоне 2016/17, приняв участие в 20 играх плей-офф и набрав 6 (3+3) очков.

В сезоне 2017-18 Скотт перешёл в «Детройт», а уже следующий году был обменян в «Баффало Сэйберз», где до 2020 года так же выступал как за основную команду и за фарм-клуб «Клинков» «Рочестер Американз» в АХЛ, после чего перешёл в систему «Флориды Пантерз». Затем в карьере Скотта были «Сиракьюз Кранч» (АХЛ, 2020/21) и «Шарлотт Чекерз» (АХЛ, 2021/22). В 2023-м году Скотт перебрался в КХЛ, где на протяжении двух сезонов выступал за «Витязь».